1. clean up意为“打扫干净，整理”。
Please clean your bedroom up. 请把你的卧室打扫干净。
He cleaned up the flower garden yesterday. 他昨天把花园整理了一番。
2.clear up意为“（天气）变晴，消除（误解等），收拾（桌子等）”。
The sky will clear up soon. 天不久就会放晴了。
They have cleared up their misunderstanding. 他们已消除了误解。
Please clear up the table. 请把桌子收拾一下。